澳門航空深圳航線於2004年3月開通，每日兩班，主力服務在廣東省的台商。但由於此航線的經濟效益未如預期，加上油價高漲，澳門航空將於5月8日停飛澳門-深圳航線，因此台灣-澳門-深圳的服務也會停止，部分接駁深圳線的台澳航班也將停飛。
5月8日起以下航班將停飛：
澳門－深圳　NX179、180、181、182
台北－澳門　NX621、622
高雄－澳門　NX663、662

因應深圳航線的停航，澳門航空將依旅客不同需求做下列安排：

1. 旅客持有全程未使用機票，請向原開票單位協助辦理退票，澳門航空免收退票手續費。
2. 旅客已使用去程機票剩下單程機票，可選擇下列任一處理方式：
   A. 旅客搭乘澳門航空安排深圳至澳門之間的「過境巴士」
   路程：東莞地區→澳門機場(全程約3.5小時)。
   車票兌換方式：旅客需於出發前3-5個工作日前至澳門航空台灣(台北/台中/高雄)或深圳分公司辦理澳門-深圳航段退票及車票兌換。將未使用機票價值及稅金扣除過境巴士車票費用後的差額申請退費作業。
   旅客在申請退票時可指定在台灣或深圳澳門航空辦事處以當地貨幣領取上述退費。
   搭乘跨境巴士所需額外稅金(如過境手續費等)則由旅客於乘車時自行支付。
   澳門機場<->東莞地區巴士時刻表澳門機場<->廣州地區巴士時刻表
   B. 旅客不需澳門航空安排巴士車票
   請至澳門航空台灣或深圳辦事處票務櫃台辦理未使用航段的機票和稅金退票申請，免收退票手續費。
   
3. 澳尊會員已開立深圳升等券和免費機票：
   已開立深圳線升等券或免費機票，但全程未使用者：澳門航空將歸還兌換時所扣哩程至會員本人帳戶，並協助開票者申請退還開立免費機票所繳的稅金。
   已開立深圳免費機票且已使用單程(台灣-澳門-深圳)：澳門航空將歸還旅客未使用航段哩程至會員本人帳戶（以兌換時所扣哩程一半計算），並協助開票者申請退還開立免費機票所繳的稅金。

上述各項退票作業的細則和規定，比照現行澳門航空退票作業實施。
如有其他各項疑問，請洽澳門航空台灣分公司或深圳分公司。

澳門航空相關辦事處	訂位組電話	票務組電話
台北	886-2-2717-0377	886-2-2717-0366
台中	886-4-2328-4333	886-4-2328-4318#11~12
高雄	886-7-251-0860	886-7-332-2699#10~12
深圳	86-775-8366-8381~2	86-775-8366-8381~2